Viện Pasteur Nha Trang có chức năng nghiên cứu khoa học về vệ sinh, dịch tễ, phòng chống dịch bệnh, chỉ đạo chuyên môn tuyến trước, đào tạo và đào tạo lại cho cán bộ chuyên ngành về YTDP...

Được tặng thưởng Huân chương Lao động hạng III năm 1981, hạng II năm 1997 và hạng I năm 2002, Huân chương Độc lập Hạng III năm 2008.